S级超影忍者作为游戏内最高品质的角色，其阵容搭配需要综合考虑忍者的技能联动、属性克制以及战斗节奏。当前版本中，以宇智波斑、千手柱间、波风水门等为核心的阵容表现尤为突出。这些忍者不仅拥有极高的基础属性，其奥义技能和被动效果也能在战斗中形成强力压制。需阵容搭配并非单纯堆砌高战力忍者，而是要根据PVP或PVE场景需求进行针对性组合。
根据实战数据分析，宇智波斑木叶创立与千手柱间秽土转生的组合能够形成完美的攻防体系。前者具备大范围控场能力，后者则拥有极强的恢复和爆发输出。搭配波风水门秽土转生的瞬发突进技能，可在开局阶段快速建立优势。在防守端，建议加入纲手或自来也舞之豪杰提供治疗支援，这种组合能有效应对持久战。部分玩家也会选择迈特凯死门作为终结者，其八门遁甲的全屏奥义往往能决定战局走向。
针对不同游戏模式需要调整阵容策略。在决斗场等PVP环境中，建议优先选择宇智波带土忍界大战配合神威卡卡西形成空间忍术联动，这种组合能有效干扰对手走位。而在团队副本或秘境探险中，则推荐以漩涡鸣人九喇嘛连结为核心构建分身输出体系，配合日向雏田的八卦掌进行范围清场。需当前版本中秽土转生系列忍者的技能冷却时间较短，更适合高频次释放奥义的战斗节奏。
资源分配方面，建议将主要培养资源集中在1-2名核心输出忍者。通过装备强化顺序优先提升武器和戒指的属性，勾玉精炼则建议平均分配保持战力平衡。饰品选择应以暴击和攻击加成为主，当暴击率达到10万左右时可转为专注攻击属性。对于月卡党玩家，可通过每日完成三倍小队突袭和生存挑战稳定获取资源，组织商店的忍玉和轮回石也是重要的战力提升途径。
随着游戏版本更新，超影服务已升级为尊享版和基础版两种模式。前者新增的修行之路扫荡奖励加成、道具商店折扣等特权能显著加速阵容成型。在近期平衡性调整后，部分忍者如九尾查克拉鸣人的机动性有所削弱，但以宇智波和秽土转生系列为主的阵容体系仍保持较高胜率。玩家可通过游戏内的自定义阵容功能保存多套预设方案，以便根据不同战斗场景快速切换。
